Deze opstelling bleek ook zeer behulpzaam zo vaak tijdens gevechten dat van beide piloten het uiterste van hun kunnen werd gevergd om het vliegtuig aan te kunnen. De extra piloot hiep ook wanneer het toestel in formatie vloog. De belangrijkste piloot kon een oog te houden op de formatie en op hetzelfde moment zijn meters in de gaten houden, zodat de co-piloot zijn meters controleerde en zorgde ervoor dat alles liep zoals het moest zijn. Deze manier van werken konden de piloten hun taken omwisselen. Vliegend in formatie voor acht en tien uur aan een stuk door was, op zijn zachtst gezegd, behoorlijk inspannend. Vele malen tijdens de missie, zou de piloot en co-piloot verwisselen van plaats, zodat niet alleen de piloot niet zelf uit te dragen, maar leerde ook de co-piloot op deze manier het formatie vliegen en bereidde hem voor op de dag dat hij zijn eigen crew zal krijgen.

Veel mensen geloven dat de co-piloot was niet zo goed als de piloot zelf, maar dat is niet waar. Beide piloten kregen dezelfde opleiding en het enige dat de twee werden gescheieden was het puur toeval, dat de één werd geplukt om piloot te worden en welke werd geplukt om een co-piloot worden. Toegegeven, sommige co-piloten kregen hun baan als gevolg van persoonlijke verschillen, dit waren uitzonderingen, niet de regel. Co-piloten kregen soms opleiding op gelegenheid ook op ander gebied. Meestal was dit of navigatie- of bommenrichter training. Op deze manier was er een back-up bemanningslid getraind in de navigatie of bombardementen in het geval een van de bemanningsleden die verantwoordelijk zijn voor deze taken niet in staat waren om ze te vervullen tijdens de missie.

Soms werd bij voorste vliegtuig in de formatie haar reguliere piloot vervangen door een officier met een hogere rang, zoals een Bomb Group, Bomb Wing of zelfs een bom Divisie commandant die in de stoel van de piloot plaats nam om de missie uit de eerste hand te observeren. In deze gevallen nam de piloot plaats in de stoel van de co-piloot en de co-piloot zou de positie innemen van de staart schutter om belangrijke informatie over de formatie door te geven aan de piloot / co-piloot. Het hielp de Wing en Group commandanten om een beter gevoel te krijgen voor wat de mannen onder hun bevel tegen kwamen, waar verbeteringen nodig waren om de bommenwerpers effectiever te maken en welke tactiek de Duitsers gebruikten tegen de bommenwerper formaties. Het was na een paar missies als deze, toen generaal LeMay kwam met zijn "Defensieve Box" formatie ,wat de kansen van de bemanningen voor het voltooien van 25 missies drastisch verbeterde.

Misschien wel het belangrijkste, en uitdagende rol van piloot was die van Crew Commander. De overige negen bemanningsleden op de Flying Fortress viel onder zijn directe bevel. Beslissingen van de piloot waren definitief en goede piloten waren altijd zeker om het welzijn van hun bemanning als topprioriteit gemaakt. Met bommenwerper bemanningen die zoveel tijd samen waren, werd het leger klassensysteem van officieren en manschappen afgebroken en de bemanning meestal handelde mekaar meer als een familie met de piloot in de rol van de vader. Zo kreeg de co-piloot vaak de rol van de moeder. Regelmatig voelden de bemanningsleden zich in de steek gelaten als men problemen of zorgen hadden als hun piloot te druk had, zich niet kon schelen, of niet beschikbaar was op het moment dat er behoefte was omnaar hun te luisteren. In die hoedanigheid trad de co-piloot op als executive officer in de pilotenrol van commandant.